Bộ Công Thương là cơ quan thường trực của Ban Chỉ đạo, trực tiếp điều hành Văn phòng Ban Chỉ đạo và phối hợp xử lý các khó khăn, vướng mắc trong triển khai dự án năng lượng trọng điểm. 
Phó Thủ tướng Chính phủ Bùi Thanh Sơn - Trưởng Ban Chỉ đạo Nhà nước các chương trình, công trình, dự án quan trọng quốc gia, trọng điểm ngành năng lượng đã ký ban hành Quyết định số 182/QĐ-BCĐNL ngày 27/12/2025 về Quy chế hoạt động của Ban Chỉ đạo.
Theo Quy chế, Ban Chỉ đạo có chức năng giúp Thủ tướng Chính phủ nghiên cứu, chỉ đạo và phối hợp giải quyết các công việc quan trọng, liên ngành trong quá trình triển khai các chương trình, công trình, dự án quan trọng quốc gia, trọng điểm ngành năng lượng. Nhiệm vụ, quyền hạn và thành phần của Ban Chỉ đạo thực hiện theo Quyết định số 2433/QĐ-TTg ngày 04/11/2025 của Thủ tướng Chính phủ.
Quy chế quy định nguyên tắc làm việc của Ban Chỉ đạo theo chế độ kiêm nhiệm, tập trung dân chủ, tập thể thảo luận, Trưởng Ban Chỉ đạo kết luận và quyết định. Các thành viên Ban Chỉ đạo chịu trách nhiệm đối với phần việc được phân công, chủ động xử lý các vấn đề thuộc chức năng, nhiệm vụ của cơ quan mình phụ trách.
Trưởng Ban Chỉ đạo ủy quyền cho các Phó Trưởng Ban xử lý những vấn đề cụ thể theo lĩnh vực được phân công; quyết định việc mời các chuyên gia trong và ngoài nước khi cần thiết. Bộ Công Thương là cơ quan thường trực của Ban Chỉ đạo.
Về trách nhiệm, Trưởng Ban Chỉ đạo chịu trách nhiệm trước Thủ tướng Chính phủ về toàn bộ hoạt động của Ban Chỉ đạo, trực tiếp chỉ đạo, điều hành và chủ trì các cuộc họp; theo dõi, đôn đốc các bộ, ngành, địa phương giải quyết các vấn đề quan trọng, liên ngành và kiến nghị hoàn thiện cơ chế, chính sách khi cần thiết.
Phó Trưởng Ban thường trực, Bộ trưởng Bộ Công Thương giúp Trưởng Ban Chỉ đạo điều hành công việc chung, trực tiếp chỉ đạo Văn phòng Ban Chỉ đạo và phối hợp đề xuất giải pháp tháo gỡ khó khăn, vướng mắc trong quá trình thực hiện các dự án. Phó Trưởng Ban là Thứ trưởng Bộ Tài chính thực hiện điều hành các nội dung liên quan theo chức năng, nhiệm vụ của Bộ Tài chính.
Quyết định số 182/QĐ-BCĐNL có hiệu lực kể từ ngày ký, thay thế Quyết định số 12/QĐ-BCĐNL ngày 25/01/2024 về Quy chế hoạt động của Ban Chỉ đạo Nhà nước các chương trình, công trình, dự án quan trọng quốc gia, trọng điểm ngành năng lượng.
